Fallet beskrivs som mycket känsligt och båda personerna hålls isolerade i separata anhållningsceller.
De misstänks för grov obehörig befattning med hemlig uppgift, ett brott av allvarlig natur.
Det rapporterar blandt andra medier som Expressen.
Säkerhetspolisen (Säpo) har offentliggjort att gripandet skedde i Storstockholmsområdet och att det är en del av en pågående förundersökning som leds av åklagare vid Riksenheten för säkerhetsmål.
Det framhålls också att det inte finns några kopplingar till tidigare ärenden.
Sveriges regering och överbefälhavare har informerats om situationen.
Hustrun till den gripna militären har också en känslig position inom myndighetsvärlden, vilket gör fallet ännu mer komplicerat.
