Incidenten, som är klassificerad som "Hemlig", kom till myndighetens kännedom under ett möte i september där anställda diskuterade "allvarliga säkerhetsbrister".
Efter mötet tog det inte lång tid innan en officiell anmälan gjordes till Säpo. Detaljerna kring händelsen är inte offentliga på grund av dess höga säkerhetsskyddsklass.
Enligt uppgifter från Svenska Dagbladet (SvD) kan anmälan potentiellt röra sig om fyra olika typer av incidenter, inklusive IT- och signalskyddsincidenter.
Det kan också vara fråga om att en säkerhetsklassificerad uppgift har avslöjats eller misstankar om annan farlig verksamhet.
SSM har även informerat Klimat- och näringsdepartementet, som har det övergripande ansvaret för myndigheten.
Kristoffer Olofsson, säkerhetsskyddschef på SSM, avböjer att ge ytterligare information om händelsen.
"Strikt sekretess gäller. Ärendet hanteras nu av Säpo, och vi följer vår handlingsplan," säger han.
Efter anmälan till Säpo har risken för eventuella negativa konsekvenser minskat, enligt SSM.
Säpo själva betonar att myndigheter och företag som hanterar känslig information snabbt bör rapportera alla säkerhetshotande händelser.
Strålsäkerhetsmyndigheten är en central myndighet med ansvar för strålskydd, kärnsäkerhet och förhindrande av nukleär spridning.
Myndighetens huvuduppgift är att skydda människor och miljö från negativa effekter av strålning.
